通過建立安全生產責任制，制定安全管理制度和操作規程，排查治理隱患和監控重大危險源，建立預防機制，規範生產行為，使各生產環節符合有關安全生產法律法規和標準規範的要求， 人、機、物、環處於良好的生產狀態，並持續改進，不斷加強企業安全生產規範化建設。
公司根據《危險化學品從業單位安全標準化通用規範》（AQ3013-2008）要求，全面開展安全生產標準化工作。建立《安全生產責任制（試行）》，層層落實各級領導、部門安全生產責任；制定並執行《安全生產管理制度匯編（試行）》；同時根據安全生產實際，制定安全生產目標，開展並長期堅持做好各項工作，包括推行崗位達標工作、推廣HAZOP方法、深化隱患排查工作、完善各項規章制度、推動安全文化知識培訓、加強安全管理隊伍建設等。
新昌製藥廠、維生素廠、昌海生物分公司為安全標準化二級達標企業。
公司經過長期的安全生產和勞動保護管理實踐，總結制定出《百乐博安全生產責任制（試行）》，根據"誰主管誰負責"的原則，明確規定了各級管理者和各部門應落實的安全生產職責，所屬單位分別制定了《安全生產責任制》，詳細規定了領導、部門、車間、有關技術人員和生產工人，各自在生產過程中應負的安全責任，將安全生產責任制全面落實，做到橫向到邊，縱向到底。
各級領導高度重視安全生產和勞動保護工作，領導和員工各司其職，各負其責，形成一個完整的、系統性的安全生產管理模式。
公司層面制定《百乐博應急預案》，從應急組織職責、事故預防、應急響應和應急結束後事項等方面作出了明確規定。所屬單位結合自身生產特點、所處地理環境等特點各自製定了綜合應急預案、專項應急預案和現場應急處置方案，並制定車間級應急逃生制度，完善了應急管理、消防管理、應急救援等體系，設有應急分隊、醫務部門等應急救援組織機構，配備專業的應急救援裝備和基礎設施。
所屬單位定期組織開展應急演練和應急專項技能比武等活動，實戰檢驗員工應急能力，並及時修訂應急預案
